百泰派克采用 QC 样本谱图比对和主成分分析两种方法,项目实验中的 QC 样本数据进行分析评价。将分析得到的 QC 样本 UPLC-QTOF-MS 总离子流图,进行谱图重叠比较,见下图。结果表明各色谱峰的响应强度和保留时间基本重叠,说明在整......
主成分分析( Principal Component Analysis, PCA) 是将原本鉴定到的所有代谢物重新线性组合,形成一组新的综合变量,同时根据所分析的问题从中选取2-3个综合变量,使它们尽可能多地反映原有变量的信息,从而达到降维......
不同于主成分分析( PCA)法,Partial Least Squares Discrimination Analysis,(PLS-DA)或 Orthogonal PLS-DA,(OPLS-DA)是一种有监督的判别分析统计方法。该方法运用......
数据的完整性和准确性是后续获得具有统计学和生物学意义的分析结果的必要 条件。在确保实验设计的合理性和实验数据的准确性的基础上,百泰派克首先对数据的完整性进行检查,对缺失值进行删除或者补充,删除极值,并对数据进行样本间和代谢物间的归一化处理,......
在进行两组样本间的差异代谢物分析时,常用的单变量分析方法包括变异倍数分析( Fold Change Analysis, FC Analysis)、T 检验,以及综合前两种分析方法的火山图( Volcano Plot)。利用单变量分析可以直观......
为了评价候选代谢物的合理性,同时更全面直观地显示样本之间的关系以及代谢物在不同样本中的表达模式差异,我们利用定性的显著性差异代谢物的表达量对各组样本进行层次聚类(Hierarchical Clustering),从而辅助我们准确地筛选标志代......
百泰派克将得到的差异代谢物使用MBRole进行代谢通路富集,使用KEGG数据库做为背景,进行相关通路分析。选取同物种的所有代谢物作为背景,分析 P value < 0.05的代谢通路。图1和2为我们可提供的两种代谢通路图,富集的代谢通......
代谢组学研究中使用的高通量方法会产生大量代谢分析相关数据, 这就需要采用生物信息学的方法进行处理。百泰派克公司生物信息学分析人员能够对代谢组学数据知识进行深度挖掘和全面分析,从质谱原始数据出发,进行峰对齐、保留时间校正和峰面积提取。代谢物结......