GO(Gene Ontology)是基因本体联合会(Gene Ontology Consortium)所建立的数据库,旨在建立一个适用于各种物种的,对基因和蛋白功能进行限定和描述的,并能随着研究不断深入而更新的语义词汇标准,适用于各物种。通......
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库是系统分析基因产物在细胞中的代谢途径以及这些基因产物功能的数据库。KEGG该数据库有助于把基因及表达信息作为一个整体的网络进行研究。KEGG整合......
COG(Clusters of Orthologous Groups)数据库是对基因产物进行同源分类的数据库,是一个较早的识别直系同源基因的数据库,通过对多种生物的蛋白质序列大量比较而来的。对所有鉴定到的蛋白进行统计,作图如下:COG功能分......
为检验所选取的差异表达蛋白质或特征差异表达蛋白质的合理性和准确性,可以通过聚类分析将蛋白按照表达量的趋势聚合在一起,可以实现更为直观的蛋白质组学数据分析。1. 层次聚类分析对筛选出的差异表达蛋白做层次聚类分析,将具有相同或相似表达模式的蛋白......
STRING是收录多个物种预测的和实验验证的蛋白质-蛋白质互作的数据库,包括直接的物理互作和间接的功能相关。结合差异表达分析结果和数据库收录的互作关系对,构建差异表达蛋白互作网络。分析过程中将差异表达蛋白映射到STRING数据库中,获得差异......
随着蛋白质组学质谱分析技术的发展,蛋白质组学分析仪器精度不断提高,由此获得的数据也更多。虽然详细的蛋白质数据信息有利于对蛋白质组学进行更为深入的研究,但是高通量蛋白质组学检测生成的大量蛋白质样本数据也给蛋白质样品特征分析带来升级的挑战。依靠......