快速的基因组规模台式测序

Ion Proton™系统是一个台式测序系统，它能够在几小时内在Ion PI™ 芯片上实现外显子组和转录组测序。

随着Ion PII™ 芯片*的发布，Ion Proton™ 系统将带来人类规模的基因组测序-一天之内从DNA到变异。

Ion Proton™ 测序仪的规格

工作环境(仅限室内使用)

温度：20–25°C

湿度：40-60% 非冷凝

海拔：<6500 ft (2,000 m)

间隙：

 后面 30.5 cm

 左侧 10 cm

 右侧 10 cm

 从工作台前缘到测序仪面板 10 cm

 工作台前方通道 90 cm，方便操作员操作

可选的机架安装，每个架子上放两台Ion Proton™ 测序仪†

气体供应

连接：0.25 in一键连接配件

压力：30 psi

成分：氮气 (4.8级，纯度为99.998%或以上)

其他连接 

以太网：1 GigE

USB：2x USB 2.0

电源

电压：100 V (min) 至240 V (max)

电流：14 A (max)

频率：50/60 Hz

耗电量：1,350 W

大小

宽度：54.2 cm

深度：77.5 cm

高度：47.4 cm

重量 

运输箱：90.7 kg

净重：59 kg

仪器的计算机硬件

处理器：两个8核Intel

® Xeon® Sandy Bridge

内存：128 GB RAM

FPGA：两个Altera® Stratix® V

GPU处理器：1 x NVIDIA® Tesla® C2075

硬盘：11 TB (SSD和HDD)

操作系统：Ubuntu ®11.10

Proton™ Torrent服务器的规格*

产品配置

  一台独立的塔式计算机设备，包含在Ion Proton™ 系统内。

 包括Torrent Suite软件以及提供信号处理、碱基检出、读取比对和变异检出所必需的所有软件组件。

处理器 ：两个8核2.9 GHz CPU

内存 128 GB RAM

GPU处理器 2x NVIDIA® Tesla® GPUs

硬盘 (大约) 27 TB (足够存储>50块Ion PI ™ 芯片的运行)

操作系统 Ubuntu® 10.04

大小 (大约) 宽度：21.8 cm 深度：71.4 cm 高度：43 cm

重量 (大约) 55 kg

电源 

 电压：100 V (min)至240 (max)

 电流：12 A (max)

 频率： 50/60 Hz

 耗电量：1,100 W

Ion Proton™ 系统的性能参数*，带Ion PI™ 芯片

通量

 高达10 Gb

(注意：Ion PII™ 芯片将在IonPI™ 芯片发布后6 个月上市。Ion PII™芯片*将在一天之内实现人类基因组的从样品到变异分析，覆盖度高达20 倍。)

读长：高达200个碱基的片段读取

通过过滤的读取数量：6000-8000万个通过过滤的读取

测序运行时间：2–4 小时

核心应用

• 人类规模的基因组测序

• 外显子组测序

• 小型基因组测序

• 基因测序

• ChIP测序

• 甲基化分析

• De novo测序

• 全转录组

• 测序法基因表达分析

• 小RNA测序

现有的文库方案：

• Ion AmpliSeq™ Library Kit

• Ion TargetSeq™ Exome Kit

• Ion Xpress™ Plus Fragment Library Kit

• Ion Total RNA-Seq Kit

感兴趣的领域：

• 农业研究

• 癌症研究

• 法医学

• 干细胞研究

• 表观基因组学

• 宏基因组学

• 古老DNA基因组学

条形码方案：Torrent Suite软件支持的384个条形码 96个DNA现货条形码 16个RNA现货条形码

软件方案：

• Torrent Suite软件利用Torrent Browser (包括TMAP比对)和Torrent Variant Caller来进行生殖细胞和体细胞突变检测

• Torrent Browser (已含)让用户可远程联网访问仪器状态监控、运行质量报告、单个数据文件以及应用特异分析可扩展插件

• 插件可从Torrent Browser Plugin Store中下载，用于基因组测序、定向测序、变异分析和注释、微生物测序的分析，转移至第三方的生物信息学软件包，以及更多数据可选择导入Ion Reporter™软件，用于可控的变异分析、注释和报告。Ion Reporter™软件为支持单个、三个或配对的肿瘤正常分析提供了应用特异的流程。

数据形式 ：行业标准的FASTQ、SFF、BAM和VCF形式输出

订购信息：

Ion Proton™ System (includes Ion Proton™ Sequencer and Proton™ Torrent Server) 货号：4476610

Ion OneTouch™ 2 System 货号：4474779

*  此处提供的内容可能涉及未正式发布的产品，随时可能更改，恕不另行通知。

为节省空间，可购买适用于Ion Proton™ 系统的机架。详询您的销售代表。

快速的基因组规模台式测序

Ion Proton 系统是一个台式测序系统，它能够在几小时内在Ion PI&#8482; 芯片上实现外显子组和转录组测序。

随着Ion PII 芯片*的发布，Ion Proton 系统将带来人类规模的基因组测序-一天之内从DNA到变异。

*  此处提供的内容可能涉及未正式发布的产品，随时可能更改，恕不另行通知。

为节省空间，可购买适用于Ion Proton系统的机架。详询您的销售代表。