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关于新冠核酸适配体的相关问题回答

2020.2.21
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梦幻般的艾克西利欧

Nothing is ture, Everything is permitted

  1. 不知您所说的夹心是什么意思?是hybridation的意思么?不知是何位置发生的?

  答:夹心是指两个aptamer可以结合在同一个分子的不同位置。这对于开发检测方法来说,就会带来极大的灵活性。如下图:

banquan3.jpeg

我们的适配体,48与(58or61号)均可实现夹心

  2. 所给适配体序列的构象如何?不知是否存在两端配对,曲形折叠结构?

  答:为了稳定结构,我们末端特意保留了一部分完全匹配的序列。但具体构相如何,目前未知。

  3. 四条所给序列 5‘端何3’端都有一段重复相同序列,是否有特殊作用呢?(已向合作者发送序列信息)

  答:两端的序列为引物区序列,我们筛选到之后进行了部分截短。这样可以缩短长度,降低生产成本,也不会影响性能。

  4、适配体能否区别死病毒和活病毒?

  答:目前未知。现在搞到病毒非常困难。尽管我们有P2和P3实验室。由于暂时还不能培养,拿到的病毒数量非常有限。

  5、序列长度多长,序列长度影响我们设计两端修饰何种信号分子。

  答:58碱基。一旦确认各种信息无误,过几天就会公布出来。、

  6、结构是结合前有三级结构还是结合后有结构。发卡型还是其他类型?

  答:一般认为适配体有两种结合模式,一种是结合前就折叠成稳定的结构,结合前后不会发生变化。另一种认为,适配体会有诱导折叠的情况,有靶标存在时才会折叠。有很多sensor都是利用这个性质来设计的。

  7、如何成为你们的合作者?

  答:有一定适配体研究基础,愿意长期开展合作,并信守承诺,如不提前公布我们提供的序列信息,以及其它未公开数据即可。申请成为合作者,请发送邮件到:lzf@ustc.edu.cn,简要介绍下情况及想法即可。我会在12小时之后回复。

  8、有关序列在哪里公布?

  答:我们还在做进一步的测试,如果没问题,就会立即公布序列。最晚不会晚于25日24时。会在知乎上发布信息。也会转变到各个相关群。


罗昭锋-中科大apt
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